Rcppとboostで微分方程式を解く

R Rcpp

Rcppとboostで微分方程式を解くををとく。 - cppファイル #include<Rcpp.h> #include <iostream> #include <array> #include <boost/numeric/odeint.hpp> using namespace Rcpp; namespace odeint = boost::numeric::odeint; using state_type = std::array< double, 1 >; //[[Rcpp::export]] NumericVector pow</boost/numeric/odeint.hpp></array></iostream></rcpp.h>…

2020-07-07

最適化パッケージの並列化 DEoptim

Rcpp

最適化パッケージの並列化 DEoptim を使う場合。 Rcppを使う場合はコンパイルしておく必要がある． arupaka-arupaka.hatenadiary.org parallelType=1 とparVar=c("x","my_func")とデータをエクスポートする。例えば、以下のコード ans2<-DEoptim(like1_web_…

2020-07-04

Rcppで使ったファイルをコンパイル済みで利用する。パッケージ化

R Rcpp

はじめに Rcppで作ったcppファイルをコンパイルしてから利用できるようにする。パッケージ化が必要らしい。具体的には以下のように行う．パッケージを作る． skeleton 関数を利用する Rcpp::Rcpp.package.skeleton("myPackage",cpp_files="test.cpp") パッ…