だから、
http://seqanswers.com/forums/showthread.php?p=154972
これを参照して旧バージョンをいれる
wget http://pkgs.fedoraproject.org/repo/pkgs/R-RSQLite/RSQLite_0.11.4.tar.gz/c2a1a8fca2146a910e9e13879a88cbc9/RSQLite_0.11.4.tar.gz
install.packages("RSQLite_0.11.4.tar.gz",lib="/usr/local/lib64/R/library/")
とすればできた！
