RのMCMCライブラリのRstanの導入
windows 8
64bit
R x64 3.0.2
- >R x64 3.2.3 （上のバージョンだと古すぎるので移行）
これに従う．
https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/RStan-Getting-Started
（１）基本の整備
バージョンにあったRtoolsのインストール
（２）gccのパスをRtoolsのものにする
（３）インストール
Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4")
install.packages("rstan", type = "source")
しかし、以下ではまる
fatal error: Eigen/Dense: No such file or directory
以下を参考に
https://groups.google.com/forum/#!topic/stan-users/oB6mI5f-8hA
必要ファイルをインストール
install.packages("RcppEigen")
もう一度、install.packages("rstan", type = "source")
とするも、ggplot2のバージョンが古いとおこられる
ggplot2はバージョン2.0．
そのためggplot2をいれるようとするも、R3.0.2では、サポートされていないので、
R3.2.3へバージョンアップ．そして，
install.packages("ggplot2")
Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4")
install.packages("rstan", dependencies = TRUE)
ですんなりインストールできた。
