RのMCMCライブラリのRstanの導入
windows 8
64bit
R x64 3.0.2
これに従う.
https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/RStan-Getting-Started
(1)基本の整備
バージョンにあったRtoolsのインストール
(2)gccのパスをRtoolsのものにする
(3)インストール
Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4")
install.packages("rstan", type = "source")
しかし、以下ではまる
fatal error: Eigen/Dense: No such file or directory
以下を参考に
https://groups.google.com/forum/#!topic/stan-users/oB6mI5f-8hA
必要ファイルをインストール
install.packages("RcppEigen")
もう一度、
Error : package 'ggplot2' 1.0.0 was found, but >= 2.0.0 is required by 'rstan'
と怒られる